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Título: Desarrollo de una aplicación de computador para analizar parámetros estadísticos genético-poblacionales de microsatélites en poblaciones humanas
Autores: Alvarado Garzón, Andrés Fernando
Fecha: 2010-07-16
Publicador: Universidad del Rosario, Colombia
Fuente:
Tipo: masterThesis
Tema: STR
Genética de poblaciones
BIOINFORMATICA
GENETICA DE POBLACION - ESTADISTICAS - PROGRMAS PARA COMPUTADOR
STR
Population genetics
Descripción: La información y los datos genéticos que emanan hoy de las investigaciones del genoma humano demandan el desarrollo de herramientas informáticas capaces de procesar la gran cantidad de información disponible. La mayor cantidad de datos genéticos es el resultado de equipos que realizan el análisis simultáneo de cientos o miles de polimorfismos o variaciones genéticas, de nuevas técnicas de laboratorio de mayor rendimiento que, en conjunto, ofrecen una mayor disponibilidad de información en un corto espacio de tiempo. Esta problemática conduce a la necesidad de desarrollar nuevas herramientas informáticas capaces de lidiar con este mayor volumen de datos genéticos. En el caso de la genética de poblaciones, a pesar de que existen herramientas informáticas que permiten procesar y facilitar el análisis de los datos, estas tienen limitaciones como la falta de conocimiento de los usuarios de algunos lenguajes de programación para alimentar la información y otras herramientas informáticas no realizan todas las estimaciones que se requieren y otros presentan limitaciones en cuanto al número de datos que pueden incorporar o manejar. En algunos casos hay redundancia al tener que usarse dos o más herramientas para poder procesar un conjunto de datos de información genética. El presente trabajo tiene por objetivo el desarrollo de una herramienta informática basada en aplicaciones de computador comunes, en este caso Microsoft Excel® y que resuelva todos los problemas y las limitaciones descritas antes. El desarrollo del conjunto de subprogramas que constituyen a Lustro; permiten superar lo anterior, presentar los resultados en un ambiente sencillo, conocido y fácil de operar, simplificando de esta forma el proceso de adaptación del usuario del programa, sin entrenamiento previo, obteniéndose en corto tiempo el procesamiento de la información genética de interés.
The information and genetic data now emanating from the human genome research demands the development of software tools capable of processing the huge amount of information available. Most genetic data is the result of teams conducting simultaneous analysis of hundreds or thousands of polymorphisms or genetic variations, new laboratory techniques for higher performance, together, provide greater availability of information in a short space time. This problem leads to the need to develop new software tools able to cope with this increased volume of genetic data. In the case of population genetics, although there are tools that can facilitate processing and data analysis, these have limitations such as lack of knowledge of users of some programming languages to feed information and other tools computer estimates do not perform all required and others have limitations on the amount of data that can be incorporated or operate. In some cases there is redundancy in having to use two or more tools to process a data set of genetic information. This work aims at developing a tool based on common computer applications, in this case Microsoft Excel ® and resolving all problems and limitations described above. The development of all subprograms that constitute Lustro, can overcome this, presenting the results at a simple, familiar and easy to operate, thus simplifying the process of adapting the program user, without prior training, resulting in short time processing of genetic information of interest.
Idioma: Español