| Título: | Metal Binding Sites in Plant Soluble Inorganic Pyrophosphatases: An Example of the Use of ROSETTA Design and Hidden Markov Models to Guide the Homology Modeling of Proteins |
| Autores: |
Rosales-León,Luis Hernández-Domínguez,Eric Edmundo Gaytán-Mondragón,Samantha Rodríguez-Sotres,Rogelio |
| Fecha: | 2012-03-01 |
| Publicador: | SCIELO |
| Fuente: |
 |
| Tipo: | journal article |
| Tema: |
Protein 3D structure comparative structural modeling pyrophosphatase EC 3.6.1.1 |
| Descripción: | In contrast to their counterparts in bacteria and animals the soluble inorganic pyrophosphatases from plant cells are active as monomers. The isoforms 1 and 4 from Arabidopsis thaliana have been characterized with more detail, but their three-dimensional structure is unavailable. Here, a recently published protocol (ROSETTA design-HMMer), is used to guide well-known techniques for homology-modeling, in the production of reliable models for the three-dimensional structure of these two arabidopsis isoforms. Their interaction with magnesium ions and pyrophosphate is analyzed in silico. |
| Idioma: | Inglés |
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