| Título: | Analysis of Genetic Expression with Microarrays using GPU Implemented Algorithms |
| Autores: |
Romero-Vivas,Eduardo Von Borstel,Fernando D. Villa-Medina,Isaac |
| Fecha: | 2013-09-01 |
| Publicador: | SCIELO |
| Fuente: |
 |
| Tipo: | journal article |
| Tema: |
GPU microarray CUDA |
| Descripción: | DNA microarrays are used to simultaneously analyze the expression level of thousands of genes under multiple conditions; however, massive amount of data is generated making its analysis a challenge and an ideal candidate for massive parallel processing. Among the available technologies, the use of General Purpose computation on Graphics Processing Units (GPGPU) is an efficient cost-effective alternative, compared to a Central Processing Unit (CPU). This paper presents an implementation of algorithms using Compute Unified Device Architecture (CUDA) to determine statistical significance in the evaluation of gene expression levels for a microarray hybridization experiment designed and carried out at the Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste S.C. (CIBNOR). The obtained results are compared to traditional implementations. |
| Idioma: | Inglés |
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